Le farine di pesce sono molto utilizzate in zootecnia in quanto vengono inserite nel pastone di suini (lattoni e magroni), giovani ruminanti e pollame (pulcini da allevamento), e nell'acquacoltura. Sono inoltre l'ingrediente principale del mangime comunemente in commercio per i pesci d'acquario e sono anche impiegate nei cibi per animali come quelli per cani e gatti.
Le farine di pesce sono ottenute da pesci di piccola taglia (interi, comprese le viscere) oppure dalle carcasse di grossi pesci (salmoni, trote, storioni, tonni), scarti delle scelte per omogeneizzati per bambini e per la gastronomia.